Em setembro de 2017, a REMEP-FLN conta com 22 instituições participantes totalizando 50 unidades.
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Informações atualizadas podem ser obtidas no Portal da REMEP-FLN.
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Sigla
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Nome
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Unidades
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| ACAFE | Associação Catarinense das Fundações Educacionais | 1 | |
| ANPRF | Academia Nacional da Polícia Rodoviária Federal | 1 | |
| ASSESC | Estácio Assesc | 1 | |
| CERTI | Fundação CERTI | 1 | |
| CIASC | Centro de Informática e Automação do Estado de Santa Catarina | 1 | |
| CIDASC | Companhia Integrada de Desenvolvimento Agrícola de Santa Catarina | 2 | |
| EPAGRI | Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa Catarina | 1 | |
| ESTACIO | Universidade Estácio de Sá | 1 | |
| FAPESC | Fundação de Amparo à Pesquisa e Inovação do Estado de Santa Catarina | 1 | |
| FEESC | Fundação de Ensindo e Engenharia de Santa Catarina | 3 | |
| IFSC | Instituto Federal de Santa Catarina | 6 | |
| IMETRO | Instituto de Metrologia de Santa Catarina | 1 | |
| SAR | Secretaria de Estado da Agricultura e da Pesca | 1 | |
| SED | Secretaria de Estado da Educação | 2 | |
| SENAI | Serviço Nacional de Aprendizagem Industrial do Estado de Santa Catarina | 1 | |
| SES-SC | Secretaria do Estado da Saúde de Santa Catarina | 3 | |
| SME | Secretaria Municipal de Educação | 2 | |
| UDESC | Universidade do Estado de Santa Catarina | 4 | |
| UFSC | Universidade Federal de Santa Catarina | 9 | |
| UNISINOS | Universidade do Vale dos Sinos | 2 | |
| UNISUL | Universidade do Sul de Santa Catarina | 5 | |
| UNIVALI | Universidade do Vale do Itajaí | 1 |
